1.进入各工作区域应当按照单一方向进行，即试剂储存和准备区→标本制备区→扩增区→扩增产物分析区。
2.各区域的设备、清洁用具标记明确，不得混用。
3.各区域的衣服用不同颜色标记，离开各区域时不得将工作服带出。
4.试验台用移动式紫外线灯消毒，高度60-90cm。扩增区延长照射时间，是过夜照射。同时各区域还需安装悬挂式紫外线灯管。
5.各试验区尽量避免不必要的走动和进出，减少风险。
6.扩增产物分析区可能会用到某些可致基因突变和有毒物质，应特别注意实验人员的安全防护。
试剂配制室及样品处理室宜呈微正压，以防外界含核酸气溶胶的空气进入，造成污染；
可以通过控制进风风量大于排风风量达到正压效果。
核酸扩增室及产物分析室应呈微负压，以防含核酸的气溶胶扩散出去污染试剂与样品，可以通过控制排风风量大于进风风量达到负压效果。
在理想情况下，PCR实验室缓冲间内，可设置正压，使室内空气不流向室外，室外空气不流向室内。
PCR实验室进风由原有中央空调控制，要求将中央空调风口安装到，且高度为地面铺装好后2600mm处。
如果使用荧光PCR仪，扩增室和产物分析室可以合并。
若房间进深允许，可设PCR内部走廊。需要指出的是在减少室内外空气交换方面，缓冲间比走廊更有意义。
各个区域之间应具备单向的实验工艺流、物流、与气流，形成单向流程的保护屏障，避免实验之间的相互干扰，防止核酸气溶胶对实验过程造成污染产生假性结果。
实验室的墙体，包括顶棚，应结构牢固、气密性好；所有阴角宜采用圆弧形线条过渡；墙体内壁光洁、不吸附、耐腐蚀、易清洗消毒；地面材料应满足无缝隙、无渗漏、光洁、耐腐蚀的要求。
无菌室是企业存放无菌产品或道具的地方，不同行业有不同的使用方法，不同位置存放不同的器材或道具。如医院的仪器、器械、平皿、纱布、手术器具等与伤口接触的任何东西都是存放在无菌室。无菌室应保持清洁，备有工作浓度的消毒液，70%的酒精，0.1%的新洁尔灭溶液等，而且严禁堆放杂物，以防污染。
无菌室空气净化工程是属于生物净化工程的一种，一般无菌室要求的洁净度为万级，标准的微生物检测实验室都会专门开辟5~8个平方出来建造无菌室，可以用板材和玻璃建造，面积不宜过大，约4~5平方米即可，高2.5米左右。无菌室只要够放置实验室样品及必需的设备即可，面积无需过大而造成浪费，面积过大对于做无菌室空气净化工程来说不仅仅是提高建造成本而已，日后的运行及维护费用也会高的令人惊讶。
无菌室外要设一个缓冲间，缓冲间的门和无菌室的门不要朝向同一方向，以免气流带进杂菌。无菌室和缓冲间都必须密闭。室内装备的换气设备必须有空气过滤装置。一般微生物检测按照实验室行业要求都需要在无菌室中进行，很多食品菌、微生物等都是在超净工作台中完成检测和化验的。
随着科技的进步，社会对饮食，健康等问题看得十分重视，无菌室的要求也越来越严格。国家为了保障人民的安全问题，无菌室在不断的普及。因此无菌室空气净化将在净化工程领域扮演着越来越重要的角色。
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